Znaczna skuteczność klasyfikacji, prostota wykonania analiz i ich niski koszt oraz potencjalne znaczenie gospodarcze uzyskanych wyników sprawiają, że w najbliższych latach należy spodziewać się dalszego dynamicznego rozwoju chemotaksonomii.
Chemotaksonomia jest metodą klasyfikacji organizmów na podstawie obecności i składu wybranych grup związków chemicznych. Zwykle jest traktowana jako uzupełnienie metod genetycznych oraz bazujących na cechach morfologicznych, ale w systematyce roślin wyższych zyskuje coraz większe znaczenie. W artykule opisane są zasady wyboru markerów taksonomicznych, przydatność różnych grup markerów oraz najczęściej stosowane metody ich analizy chemicznej.